Крупнейшие отраслевые союзы продовольственного сектора (в том числе Союзмолоко) обратились к министру транспорта Андрею Никитину и главе ФНС Даниилу Егорову с просьбой дать официальные разъяснения по налоговому и административному признанию бумажных перевозочных документов в переходный период внедрения электронных перевозочных документов (ЭПД). Как следует из писем, бизнес опасается, что даже при обещанном моратории на штрафы ГИБДД компании столкнутся с доначислениями нлога на прибыль и отказом в вычетах по НДС.  

С 1 сентября 2026 года вступает в силу Федеральный закон от 07.06.2025 № 140-ФЗ, который вводит обязательность формирования перевозочных документов (транспортных накладных, заказов, экспедиторских документов) в электронном виде с направлением в государственную информационную систему электронных перевозочных документов (ГИС ЭПД), следует из текста обращения. При этом отрасль ранее «обозначала проблему неготовности» к переходу по ряду объективных причин: неготовность контрагентов-перевозчиков к обмену электронными документами, проблемы с интернет-соединением на трассах, отсутствие регламентов аварийных режимов и ограниченность роуминга документов.

Союзы и ассоциации поддержали позицию Минтранса о необходимости адаптационного периода, озвученную на совещании с президентом 23 июня 2026 года. Однако бизнес попросил конкретизировать условия этого периода, чтобы избежать двойного толкования закона.

Два вида рисков

В письме на имя министра транспорта Андрея Никитина отраслевые союзы просят выпустить разъяснения о неприменении штрафных санкций за оформление ЭПД в бумажном виде в отношении всех участников перевозки. Согласно предложению бизнеса, при проверках инспекторы ГИБДД и Ространснадзора должны ограничиваться устным замечанием, «которое не влечёт составления протокола, не фиксируется в базах данных нарушений и не учитывается при применении мер ответственности в будущем».

Второе, более чувствительное требование, адресовано главе ФНС Даниилу Егорову. Союзы просят подготовить совместное разъяснение Минфина и ФНС о признании бумажных перевозочных документов надлежащими первичными документами для целей налогового и бухгалтерского учёта — как оформленных в исключительных случаях, предусмотренных приказами Минтранса №262 и №115, так и в иных случаях в период до 1 марта 2027 года.

«Если бумажные перевозочные документы формально нелегитимны (поскольку ФЗ №140 с 1 сентября 2026 года вводит обязательность использования электронных форматов), налоговая может не принять расходы по такой перевозке. Это приведёт к доначислению налога на прибыль и штрафам, и, как следствие, к убыткам, которые существенно превышают любые административные штрафы ГИБДД», — говорится в обращении к Егорову.

Позиция Минтранса

В ответе Минтранса ведомство сообщило, что в рамках перечня поручений президента от 19.07.2026 № Пр-1784 МВД России и Ространснадзор «будут приниматься решения, предусматривающие до 01.03.2027 объявление устного замечания участникам перевозочного процесса в случае отсутствия у них электронных перевозочных документов и их предъявления на бумажном носителе».

При этом Минтранс отказал в расширении перечня случаев оформления экспедиторских документов на бумаге, утверждённого приказом №115. Ведомство указало, что «расширение перечня случаев оформления экспедиторских документов на бумажном носителе не соответствует целеполаганию внесения изменений в законодательство» в части введения обязательного электронного документооборота. Также в Минтрансе заявили, что «осуществление мультимодальных перевозок грузов не является достаточным основанием для сохранения документооборота на бумажном носителе».

Вместе с тем ведомство сообщило, что разрабатывает памятку для участников информационного взаимодействия с алгоритмом действий при недоступности ГИС ЭПД, а также прорабатывает создание на портале системы раздела со статусом её работы. Кроме того, в ответе указано, что при недоступности ГИС ЭПД обработка документов осуществляется в информационных системах операторов, а их предоставление возможно с использованием QR-кода.

Минтранс также отметил, что не наделён полномочиями по разъяснению законодательства и практики его применения, и перенаправил вопросы по налоговому и бухгалтерскому учёту в Минфин и ФНС, а по административным правонарушениям (часть 2 статьи 12.3 КоАП) — в МВД России.

Ответ ФНС

В ответе ФНС налоговая служба указала, что вопросы разъяснения неприменения штрафных санкций и внесения изменений в приказы Минтранса относятся к исключительной компетенции Минтранса.

При этом ФНС дала разъяснение по существу налоговых рисков. Ведомство ссылается на пункт 1 статьи 252 НК РФ, согласно которому расходами признаются обоснованные и документально подтверждённые затраты, и на подпункт 1 пункта 2 статьи 171 НК РФ о вычетах по НДС на основании счетов-фактур и первичных документов.

«Сам по себе факт оформления перевозочных документов на бумажном носителе не является самостоятельным основанием для наступления негативных налоговых последствий в части признания расходов при исчислении налога на прибыль организаций — при условии наличия доказательств объективной невозможности формирования перевозочных документов в электронной форме», — говорится в ответе ФНС.

В письме также указано, что налоговые органы при оценке обоснованности расходов будут анализировать «совокупность обстоятельств», в частности подтверждающих реальность фактов хозяйственной деятельности и отсутствие искажений сведений о ней (статья 54.1 НК РФ).

Вместе с тем ФНС подчеркнула, что данное письмо не является нормативным правовым актом, «не влечёт изменений правового регулирования налоговых отношений, не содержит норм, влекущих юридические последствия для неопределённого круга лиц, носит информационный характер и не препятствует налогоплательщикам руководствоваться нормами законодательства в понимании, отличающемся от положений настоящего письма».

Помимо налоговых разъяснений, в обращении к Минтрансу союзы также просили:

• разработать механизм аварийного режима работы ГИС ЭПД и порталов операторов с чётким регламентом действий при недоступности системы (в ответе Минтранса сообщается о разработке памятки и раздела на портале);
• установить право оформления экспедиторских документов на бумаге при мультимодальных перевозках (Минтранс отказал, указав, что это не основание);
• исключить из пунктов 3 и 4 приказа №115 слова «в связи с обстоятельствами непреодолимой силы», поскольку условие доказывания форс-мажора, по мнению бизнеса, «одновременно и существенно сужает перечень случаев технических проблем и усложняет процедуру» (Минтранс в ответе не поддержал это предложение, сославшись на целеполагание реформы и отметив, что свидетельствование форс-мажора осуществляется Торгово-промышленной палатой).